中國工業(yè)報 曹君君 

    全球疫情肆虐，各大科技公司都在竭盡全力抗擊疫情。近日，阿里云對外宣布，將向全球醫(yī)療科研機(jī)構(gòu)、疾控中心等一線病毒研究機(jī)構(gòu)免費開放云上病毒比對服務(wù)，可大幅提升病毒基因檢測效率，最快只需60秒即可完成包括新冠病毒在內(nèi)的任意病毒基因?qū)Ρ裙ぷ鳎瑢M(jìn)一步了解病毒變異提供有效依據(jù)。這是繼此前宣布AI算力免費后，阿里云再次用技術(shù)“搶奪”寶貴時間。

    病毒經(jīng)過數(shù)代傳播，會產(chǎn)生變異，追蹤掌握病毒變異情況成為科研人員的重中之重。宏基因組測序mNGS是目前較為有效的追蹤方案，配合病毒庫可精準(zhǔn)確定病毒的代際關(guān)系，甚至找到病毒源發(fā)地。但此前的mNGS數(shù)據(jù)分析較為耗時，以某新冠重癥患者為例，系統(tǒng)需要對2200萬個序列超過32億個堿基一一和病毒庫比對，檢測出新冠病毒特征區(qū)域的完全匹配系列，通常這一過程需要30分鐘或更久。 此次阿里云免費開放的基因計算服務(wù)AGS（Alibaba Genomics Service），采用容器技術(shù)和GPU，即開即用，可同時運行多個病毒基因比對服務(wù)，大大縮短了這一進(jìn)程，60秒內(nèi)即可獲取高質(zhì)量的基因比對報告，為患者提供更為準(zhǔn)確的醫(yī)療方案。 包括疾控中心、各大高校、醫(yī)院、基因企業(yè)等一線病毒研究機(jī)構(gòu)可在阿里云上申請快速開通基因計算服務(wù)，為進(jìn)一步研究病毒蛋白質(zhì)及變異提供準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)支撐。 

    目前，國內(nèi)基因公司安諾優(yōu)達(dá)已開始借助阿里云的計算能力從某腫瘤樣本數(shù)據(jù)中尋找病毒相關(guān)序列的數(shù)據(jù)，用于研究病毒活動與某腫瘤發(fā)生的相關(guān)性。